南通瑞慈医院药剂科现设有临床药学室、门诊药房、病房药房、儿童医院药房、急诊药房、中药房、静脉营养配置中心（在建）等七个部门，担负全院的药事管理、药品供应工作。现有药学专业33名，其中正主任药师2人，副主任药师5人，主管药师5人。本科以上学历者28人，具执业药师资格者11人。

科室本着“以人为本”的对外服务和对内管理理念，团结每位员工，严格执行各项服务规范，严抓业务本领，历年来在省市各级专业及竞技比赛中获得多项奖励，在医院进行的各项评比和考评中均取得较好的成绩。在新医改形势下，紧跟药学转型服务模式，以保障临床、患者基本用药为基础，开展多维度的临床药学服务并取得不菲的成绩：连续十多年获得“南通市药品不良反应监测先进工作单位”称号；2020年，获“江苏省药学会-天晴医院药学科研项目”一项；2021年加盟“江海抗凝药学管理联盟”；建立“PCCM药学服务咳喘门诊”（在建）等；多次开展药学科普进社区活动。在抗击疫情这场特殊的战役中，药剂科一方面做好防疫物资的储备供应，一方面积极响应号召，参加高速公路防控及全民核酸监测工作。在圆满完成各项工作以外，注重人才梯队建设，制定切实可行的继续教育计划，定期选派专业人员赴临床药学培训基地学习，苦练药学专业基本功，加强临床药学知识的学习储备，为更好地融合新医改政策，为保障患者用药安全而不懈努力。